巧克力囊肿，医学上称为子宫内膜异位囊肿，是一种与子宫内膜异位症相关的妇科疾病。这种病症的特点是子宫内膜组织(正常情况下应长在子宫腔内的组织)生长在子宫以外的地方，尤其是在卵巢上形成含有深棕色血液的囊肿。这些囊肿内血液由于长时间的滞留而呈深棕色，类似熔化的巧克力，因此得名“巧克力囊肿”。
巧克力囊肿通常不会自愈。虽然症状可能会随时间波动，有时甚至在没有任何治疗的情况下暂时减轻，但这并不意味着病情已经自行解决。没有适当的治疗，囊肿和异位组织仍然存在，并且可能会继续增长或导致进一步的健康问题。
疼痛加剧：患者可能会经历周期性的下腹部疼痛、痛经、性交疼痛等，且随着时间推移疼痛可能加剧。
月经不规律：月经周期可能异常，出血量也可能有所改变，给女性带来不便和困扰。
不孕风险增加：巧克力囊肿可能会影响女性的生育能力，增加不孕的风险。它可能通过影响卵子的质量、阻碍输卵管通畅或干扰胚胎着床来实现这一点。
粘连和器官损伤：长期的炎症反应可能导致盆腔内组织粘连，影响器官功能，甚至导致肠梗阻等严重并发症。
心理影响：长期的痛苦和生育问题可能导致焦虑、抑郁等心理问题，进一步影响患者的心理健康。
生活质量下降：持续的疼痛和不适可能会严重影响患者的日常生活和工作，导致生活质量显著下降。
囊肿破裂：在某些情况下，巧克力囊肿可能会破裂，导致急性腹痛和其他并发症。